http://www.sciencehuman.com 科学人 网站 2010-10-27
深圳特区报讯 (记者 谭大跃 通讯员 王静思)由中国农业大学玉米中心、华大基因研究院、美国爱荷华大学、明尼苏达大学等单位合作的研究成果——“基因丢失与获得的多态变化揭示玉米中的杂交优势的机制”,于北京时间今天凌晨1时在国际著名杂志《自然—遗传学》上在线发表。
据悉,该研究报道了中国重要玉米骨干亲本的全基因组的单核苷酸多态性、插入/缺失多态性以及基因获得和缺失变异图谱,对玉米的遗传学研究和分子育种提供了非常有价值的资源。
华大基因研究院的项目负责人徐讯介绍,该项研究对6个中国重要玉米杂交组合骨干亲本进行全基因组重测序,利用SOAP软件v2.18比对获得的12.6亿75bp的双末端片段与玉米的参考基因组序列,发现了100多万个单核苷酸多态性位点(SNPs)和3万多个插入缺失多态性位点(IDPs),建立了高密度的分子标记的基因图谱。同时,还发现了101个低序列多态性区段,在这些区段中含有大量在选择过程中与玉米性状改良有关的候选基因。这些发现不仅为高产杂交玉米育种骨干亲本的培育提高了重要的多态性标记,同时也补充了玉米基因数据集,为进一步挖掘玉米基因组和遗传资源提供了大量数据。
报道指出,目前的育种对遗传资源的组合利用还是有限的,玉米的育种还存在着巨大的潜力。除此之外,该报道还发现这些骨干亲本组合基因组的组合可以弥补另一方功能元件的缺失,这种基因丢失与获得的多态变化和其他无义突变的互补作用可能与杂种优势有关。
[深圳特区报]