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四川首批体细胞克隆地方猪诞生
新华社成都10月2日电（记者 吴晓颖）记者1日从四川农业大学获悉，位于巴中市的一个青峪猪原种场内，4头通过青峪猪体细胞克隆和胚胎移植技术受孕的母猪，近日顺利产下23头健康状况良好的纯种青峪猪仔猪。这是四川首次将非基因编辑体细胞克隆技术运用于地方猪资源保护。
据悉，被称为“巴中土猪”的青峪猪是四川省地方猪种，被列为四川省畜禽遗传资源保护名录。为加强对地方猪品种遗传资源的有效保护，四川已在全省建成7个地方猪品种的遗传资源保种场（区）和一个四川省级畜禽遗传资源基因库。
作为此次体细胞克隆猪的主要研发单位，四川农业大学与四川省畜牧总站合作开展一系列保种新技术研发和利用工作。2017年，四川农业大学动物科技学院教授朱砺团队开始实施“青峪猪冷冻精液制作及重要经济性状挖掘”项目，形成了一套成熟的冷冻精液制作和保存技术。2018年，朱砺团队对四川地方猪品种制作冷冻精液，实现了对父系血缘的保护。
2019年3月，为应对非洲猪瘟疫情对地方猪遗传资源的威胁，实现遗传资源保存和活体恢复，朱砺团队联合巴中市巴山牧业股份有限公司开展青峪猪体细胞克隆试验。5月，团队培育出克隆胚胎。6月，完成4头代孕母猪的胚胎移植。
朱砺说，体细胞克隆青峪猪的成功分娩，实现了地方猪遗传材料的长期保存和活体恢复，证明四川农业大学全面掌握了在重要疫情形势下保护地方猪品种遗传资源的综合应对措施，对现实生产具有重大意义。
[新浪网]
首个亚洲家猪“超清”基因组图谱发布
陆川猪染色体级别定相（Phased）基因组的组装。唐中林供图
近日，生物学预印本服务器（BioRxiv）在线发表了中国优良地方猪——陆川猪的染色体级别的高质量定相（Phased）基因组序列。这不仅填补了亚洲家猪缺少高质量参考基因组的空白，更为基因组组装提供了新的方向。该项成果由中国农业科学院深圳农业基因组研究所（以下简称“基因组所”）猪基因组设计育种创新团队主导完成。
项目负责人、基因组所研究员唐中林告诉《中国科学报》，利用多项测序技术和组装算法，他们首次获得了染色体级别、完整的两套基因组序列。这标志着来自亲本的等位基因可以完整区分，为研究等位基因的功能互作提供了宝贵的数据和技术基础，具有重要的理论和应用价值。
“包括人在内的很多物种，都是二倍体。也就是说，每一个二倍体个体中都有两套不同亲本来源的单倍体序列。我们组装得到的猪基因组，除了有很高的连续性外，更是成功地获得了2套染色体级别的基因组序列，这在基因组组装研究领域尚属首次。”唐中林说，“这意味着我们可以同时研究同源染色体的变异，以及来自不同亲本的等位基因功能。这是基因组学领域科学家们梦寐已久的，今天我们向前迈了一大步。”
据介绍，东西方猪种拥有各自独立的驯化起源，分属两个不同的进化分支，且具有明显的形态和遗传学差异。然而，目前猪基因组学研究采用的是西方猪种杜洛克（Duroc）的基因组序列，这在一定程度上限制了对亚洲家猪的基因组学研究。
进化研究表明，陆川猪和杜洛克猪的分化时间约为170万年前。项目参与方、深圳凌恩生物CEO牛永超介绍，通过比较二者基因组，他们发现陆川猪的272个阳性选择基因在蛋白酪氨酸激酶活性、微管运动活性、GTPase激活物活性和泛素蛋白转移酶活性等方面均显著富集，而杜洛克猪阳性选择基因与G蛋白偶联受体活性密切相关。这不仅为猪遗传学领域提供了关键的基准数据，而且为利用猪做模式动物研究人类健康和疾病开辟了一条新的道路。
唐中林介绍，我国是世界上最大的生猪养殖和猪肉消费国，拥有全球1/3的猪品种。这些资源是深入挖掘地方猪肉质和抗病力等重要性状优质基因的遗传宝库。然而，随着西方商业猪种的普及，本地猪种受到了非常大的冲击，有些著名地方品种的数量比大熊猫还要稀少，部分品种甚至已经灭绝。地方猪种质资源的保护刻不容缓，尤其在面对非洲猪瘟挑战的今天，该基因组的发布更是具有重要的战略意义。
该研究得到国家自然科学基金重点项目、转基因重大专项、深圳市科创委和中国农业科学院创新工程的支持。
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